Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABEP1Q15276 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABEP1Q15276 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
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