Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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