Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKD1Q15139 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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