Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HERC3Q15034 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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