Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAPTM4AQ15012 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAPTM4AQ15012 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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