Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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