Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFIXQ14938 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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