Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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