Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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GBX1Q14549 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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GBX1Q14549 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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GBX1Q14549 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GBX1Q14549 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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