Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
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CNGB1Q14028 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
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CNGB1Q14028 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
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CNGB1Q14028 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
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CNGB1Q14028 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGB1Q14028 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
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