Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CKAP5Q14008 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CKAP5Q14008 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
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