Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOFQ13790 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOFQ13790 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOFQ13790 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOFQ13790 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOFQ13790 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOFQ13790 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOFQ13790 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOFQ13790 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOFQ13790 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOFQ13790 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOFQ13790 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOFQ13790 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOFQ13790 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOFQ13790 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOFQ13790 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOFQ13790 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOFQ13790 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOFQ13790 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOFQ13790 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOFQ13790 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOFQ13790 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOFQ13790 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOFQ13790 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOFQ13790 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOFQ13790 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOFQ13790 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOFQ13790 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOFQ13790 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOFQ13790 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOFQ13790 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOFQ13790 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOFQ13790 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOFQ13790 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOFQ13790 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms