Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
NCOA4Q13772 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCOA4Q13772 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NCOA4Q13772 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NCOA4Q13772 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCOA4Q13772 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA4Q13772 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA4Q13772 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA4Q13772 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA4Q13772 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA4Q13772 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA4Q13772 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA4Q13772 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA4Q13772 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA4Q13772 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA4Q13772 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA4Q13772 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA4Q13772 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA4Q13772 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA4Q13772 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA4Q13772 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NCOA4Q13772 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA4Q13772 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA4Q13772 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCOA4Q13772 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA4Q13772 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA4Q13772 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA4Q13772 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA4Q13772 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA4Q13772 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA4Q13772 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA4Q13772 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA4Q13772 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA4Q13772 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCOA4Q13772 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCOA4Q13772 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA4Q13772 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA4Q13772 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCOA4Q13772 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA4Q13772 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA4Q13772 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA4Q13772 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA4Q13772 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCOA4Q13772 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA4Q13772 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA4Q13772 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA4Q13772 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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