Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX3Q13761 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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