Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PKD2Q13563 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PKD2Q13563 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
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