Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TUBB3Q13509 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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TUBB3Q13509 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBB3Q13509 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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