Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD4Q13485 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
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