Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCOF1Q13428 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
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TCOF1Q13428 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
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TCOF1Q13428 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
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