Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF1Q13351 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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