Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.411e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.291e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.291e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 POLD4-209ENST00000533429 860 ntTSL 1 (best)15.5■□□□□ 0.071e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 MAPK3-213ENST00000485579 739 ntTSL 220.03■□□□□ 0.89e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.339e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.172e-6■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 SHARPIN-201ENST00000359551 1687 ntTSL 1 (best)28.42■■■□□ 2.142e-6■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 SHARPIN-206ENST00000532536 533 ntTSL 38.09□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 AC008763.2-202ENST00000599243 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 423.22■■□□□ 1.316e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.386e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.051e-8■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.831e-8■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 ARPC5L-203ENST00000465124 1877 ntTSL 215.97■□□□□ 0.151e-8■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 RHOC-213ENST00000473074 943 ntTSL 516.43■□□□□ 0.228e-12■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 TSNAX-DISC1-203ENST00000602885 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.93■□□□□ 0.143e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 TSNAX-DISC1-204ENST00000602956 3294 ntAPPRIS P5 TSL 212.53□□□□□ -0.43e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 TSNAX-DISC1-202ENST00000602634 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.24□□□□□ -0.453e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 TSNAX-DISC1-201ENST00000602567 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.92□□□□□ -0.53e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 TSNAX-DISC1-205ENST00000602962 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.543e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 TSNAX-201ENST00000366639 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.683e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 TSNAX-203ENST00000475168 5629 ntTSL 28.67□□□□□ -1.023e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC8.92□□□□□ -0.981e-6■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 PIN1-202ENST00000380889 1670 ntTSL 1 (best)25.64■■□□□ 1.696e-11■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 PIN1-210ENST00000591777 533 ntTSL 313.97□□□□□ -0.176e-11■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.782e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 RPS18-235ENST00000479802 413 ntTSL 214.21□□□□□ -0.134e-88■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.756e-7■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 SAMD4B-206ENST00000596368 1176 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.276e-10■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.483e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.423e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 PPP1R12C-209ENST00000592993 2269 ntTSL 1 (best)23.13■■□□□ 1.293e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.033e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 13e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.923e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.773e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.673e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 DEF8-209ENST00000562986 468 ntTSL 419.07■□□□□ 0.643e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 DEF8-223ENST00000568760 579 ntTSL 419.04■□□□□ 0.643e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 DEF8-208ENST00000562578 573 ntTSL 418.88■□□□□ 0.613e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 DEF8-213ENST00000563848 649 ntTSL 318.38■□□□□ 0.533e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.532e-17■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.483e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.423e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.412e-17■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.323e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 PGGHG-206ENST00000476372 2879 ntTSL 217■□□□□ 0.313e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.283e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 MIR600HG-202ENST00000545631 5977 nt16.61■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.61■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 DEF8-205ENST00000561959 558 ntTSL 516.59■□□□□ 0.253e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 AP002360.2-201ENST00000530759 599 ntTSL 216.39■□□□□ 0.213e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.073e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 PGGHG-205ENST00000474221 4418 ntTSL 215.48■□□□□ 0.073e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.063e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.063e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 PGGHG-203ENST00000409548 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.143e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 MYL4-207ENST00000572303 544 ntTSL 312.9□□□□□ -0.344e-25■■■■□ 21.8
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PABPC4Q13310 DEF8-201ENST00000268676 3725 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.423e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 DEF8-227ENST00000570182 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.433e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 DDX31-205ENST00000438527 2814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.493e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 DARS-210ENST00000489964 827 ntTSL 211.54□□□□□ -0.564e-25■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 COL4A3BP-202ENST00000357457 886 ntTSL 510.6□□□□□ -0.712e-17■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 DEF8-206ENST00000562044 535 ntTSL 310.48□□□□□ -0.733e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 STRBP-210ENST00000530364 285 ntTSL 39.12□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 NGDN-209ENST00000556483 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.52□□□□□ -1.373e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 COL4A3BP-205ENST00000508692 508 ntTSL 55.33□□□□□ -1.562e-17■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 AL020996.2-201ENST00000559265 568 ntTSL 423.88■■□□□ 1.412e-10■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.232e-10■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.082e-10■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.082e-10■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 AL020996.2-202ENST00000527604 334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.832e-10■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 SELENON-205ENST00000630065 2994 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.882e-10■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 RPS10-203ENST00000464218 615 ntTSL 514.79□□□□□ -0.042e-7■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 RPS10-206ENST00000494077 781 ntTSL 213.97□□□□□ -0.172e-7■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 RPS10-204ENST00000467531 777 ntTSL 213.1□□□□□ -0.312e-7■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 RPS10-202ENST00000344700 650 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.452e-7■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 CNIH1-206ENST00000557659 856 ntTSL 213.67□□□□□ -0.223e-11■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.677e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 TIMM17B-207ENST00000490755 666 ntTSL 521.2■□□□□ 0.983e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.892e-19■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 TMEM120A-209ENST00000480899 765 ntTSL 517.05■□□□□ 0.321e-7■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 PPP2R5C-202ENST00000334743 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.579e-8■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.412e-21■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.452e-21■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.712e-21■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.144e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.134e-9■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.482e-13■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 SH3BGR-204ENST00000380637 1014 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.32e-13■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.92e-13■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 SH3BGR-208ENST00000452550 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.33□□□□□ -1.242e-13■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 SH3BGR-207ENST00000447939 512 ntTSL 26.13□□□□□ -1.432e-13■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 ZNHIT1-204ENST00000492315 3958 ntTSL 210.15□□□□□ -0.797e-8■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.251e-6■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.961e-6■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.551e-6■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 RNF166-208ENST00000567408 313 ntTSL 223.85■■□□□ 1.411e-6■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 RNF166-205ENST00000562544 502 ntTSL 519.92■□□□□ 0.781e-6■■■■□ 21.8
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