Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SKP2Q13309 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms