Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ERCC8Q13216 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ERCC8Q13216 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ERCC8Q13216 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ERCC8Q13216 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ERCC8Q13216 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERCC8Q13216 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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