Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IRF3-212ENST00000596756 931 ntTSL 513.88□□□□□ -0.192e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MAGI1-203ENST00000460329 3694 ntTSL 513.19□□□□□ -0.32e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.342e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 ZNRF1-211ENST00000579084 571 ntTSL 512.8□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 PSMD13-209ENST00000529372 612 ntTSL 512.7□□□□□ -0.382e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MAGI1-204ENST00000463103 4193 ntTSL 512.58□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.432e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 PSMD13-201ENST00000352303 1427 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 PSMD13-208ENST00000528906 858 ntTSL 512.31□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 RALBP1-203ENST00000458039 836 ntTSL 312.18□□□□□ -0.462e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 PTK2B-217ENST00000522517 651 ntTSL 312.1□□□□□ -0.472e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IPO5-202ENST00000357602 4335 ntAPPRIS P1 TSL 512.05□□□□□ -0.482e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 PSMD13-206ENST00000527047 1284 ntTSL 1 (best)11.35□□□□□ -0.592e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 RALBP1-202ENST00000383432 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 PSMD13-205ENST00000526783 892 ntTSL 510.98□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 RALBP1-201ENST00000019317 4368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 BRD7-201ENST00000394688 5370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 PSMD13-214ENST00000534590 787 ntTSL 510.15□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 DDX46-202ENST00000452510 5689 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 NOTCH2NL-203ENST00000578207 5042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.912e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 BRD7-204ENST00000475877 671 ntTSL 39.12□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 UBE2E1-203ENST00000424381 1224 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.992e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 UBE2E1-206ENST00000467766 585 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.992e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 PNISR-207ENST00000478777 2422 ntTSL 28.72□□□□□ -1.012e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.022e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IPO5-208ENST00000469360 3505 ntTSL 28.32□□□□□ -1.082e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 DDX46-207ENST00000507392 3565 ntTSL 27.96□□□□□ -1.132e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.162e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.162e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 UBE2E1-205ENST00000452012 1166 ntTSL 37.44□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 MAGI1-207ENST00000470990 2138 ntTSL 1 (best)7.43□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.232e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 DAAM1-203ENST00000553307 1430 ntTSL 26.86□□□□□ -1.312e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 PNISR-206ENST00000476159 537 ntTSL 36.51□□□□□ -1.372e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.372e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 DAAM1-207ENST00000555651 2797 ntTSL 26.02□□□□□ -1.452e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.52e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IPO5-223ENST00000491555 3688 ntTSL 25.04□□□□□ -1.62e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 UBE2G1-205ENST00000574059 569 ntTSL 44.96□□□□□ -1.622e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.642e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 DTL-204ENST00000489149 815 ntTSL 24.62□□□□□ -1.672e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 DAAM1-205ENST00000553966 1864 ntTSL 24.3□□□□□ -1.722e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.752e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 DTL-205ENST00000496442 485 ntTSL 23.89□□□□□ -1.792e-6■■■■□ 22.3
TARDBPQ13148 AC078845.1-201ENST00000445293 889 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.953e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.673e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.033e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 CYP2R1-210ENST00000534686 1668 ntTSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.273e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 CYP2R1-206ENST00000530609 1882 ntTSL 1 (best)11.39□□□□□ -0.593e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 CYP2R1-203ENST00000526276 725 ntTSL 26.11□□□□□ -1.433e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 CYP2R1-205ENST00000529043 482 ntTSL 35.22□□□□□ -1.573e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.053e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 EPB41-210ENST00000482464 675 ntTSL 217.35■□□□□ 0.374e-7■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.154e-7■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 EPB41-203ENST00000349460 3029 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.814e-7■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 EPB41-207ENST00000373800 2853 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.854e-7■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 EPB41-204ENST00000356093 5857 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.944e-7■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 EPB41-206ENST00000373798 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.964e-7■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 EPB41-202ENST00000347529 2676 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.064e-7■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.224e-7■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.315e-7■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.235e-7■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 DAPK1-206ENST00000469067 2499 ntTSL 215.88■□□□□ 0.135e-7■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 DAPK1-217ENST00000496522 579 ntTSL 215.65■□□□□ 0.15e-7■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 DAPK1-210ENST00000472344 548 ntTSL 514.29□□□□□ -0.125e-7■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.425e-7■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 DAPK1-213ENST00000491893 4186 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.555e-7■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 DAPK1-219ENST00000622514 5772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.65e-7■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 DAPK1-209ENST00000472284 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.645e-7■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 DAPK1-212ENST00000489291 4334 ntTSL 1 (best)9.33□□□□□ -0.925e-7■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 ZNF518A-205ENST00000488700 729 ntTSL 217.94■□□□□ 0.466e-8■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 ZNF518A-201ENST00000316045 7277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.016e-8■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 ZNF518A-208ENST00000563195 1594 ntTSL 37.42□□□□□ -1.226e-8■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 ZNF518A-207ENST00000539666 485 ntTSL 45.7□□□□□ -1.56e-8■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 ZNF518A-203ENST00000478086 1579 ntTSL 1 (best)4.49□□□□□ -1.696e-8■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.256e-8■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.881e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.412e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.192e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.292e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.362e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 LRBA-207ENST00000509835 5578 ntTSL 1 (best)6.53□□□□□ -1.362e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 PSD4-202ENST00000409378 580 ntTSL 318.05■□□□□ 0.481e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 PSD4-211ENST00000487574 670 ntTSL 417.96■□□□□ 0.471e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 PSD4-203ENST00000409656 2394 ntTSL 216.18■□□□□ 0.181e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.011e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 PSD4-206ENST00000460725 2763 ntTSL 214.62□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 PSD4-204ENST00000418251 5600 ntTSL 513.79□□□□□ -0.21e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 PSD4-208ENST00000465592 548 ntTSL 412.69□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 PSD4-205ENST00000441564 11234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.771e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 PVT1-204ENST00000517525 392 ntTSL 324.55■■□□□ 1.522e-6■■■■□ 22.2
TARDBPQ13148 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.292e-6■■■■□ 22.2
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 437.1 ms