Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PDZK1IP1Q13113 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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PDZK1IP1Q13113 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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PDZK1IP1Q13113 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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PDZK1IP1Q13113 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDZK1IP1Q13113 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDZK1IP1Q13113 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDZK1IP1Q13113 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDZK1IP1Q13113 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDZK1IP1Q13113 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDZK1IP1Q13113 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDZK1IP1Q13113 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDZK1IP1Q13113 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDZK1IP1Q13113 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDZK1IP1Q13113 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDZK1IP1Q13113 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDZK1IP1Q13113 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDZK1IP1Q13113 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDZK1IP1Q13113 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDZK1IP1Q13113 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDZK1IP1Q13113 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDZK1IP1Q13113 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDZK1IP1Q13113 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDZK1IP1Q13113 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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