Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHAF1AQ13111 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHAF1AQ13111 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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