Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKRN3Q13064 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN3Q13064 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
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