Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRDM2Q13029 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRDM2Q13029 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
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