Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK2Q13002 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms