Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HSPB3Q12988 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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