Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXF1Q12946 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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