Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREBF2Q12772 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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