Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms