Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DSC1Q08554 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DSC1Q08554 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms