Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDR1Q08345 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms