Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms