Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP1-1Q07627 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms