Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4BQ07343 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms