Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TNP2Q05952 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms