Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ATP7AQ04656 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP7AQ04656 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms