Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ARID5AQ03989 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID5AQ03989 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms