Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms