Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
DSG1Q02413 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DSG1Q02413 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms