Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN10P78369 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN10P78369 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN10P78369 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLDN10P78369 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN10P78369 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN10P78369 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN10P78369 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLDN10P78369 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN10P78369 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN10P78369 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN10P78369 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN10P78369 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN10P78369 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN10P78369 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN10P78369 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN10P78369 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN10P78369 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN10P78369 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN10P78369 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLDN10P78369 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN10P78369 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN10P78369 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN10P78369 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN10P78369 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN10P78369 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN10P78369 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN10P78369 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN10P78369 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN10P78369 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN10P78369 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN10P78369 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN10P78369 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN10P78369 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLDN10P78369 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLDN10P78369 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN10P78369 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN10P78369 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN10P78369 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLDN10P78369 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN10P78369 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN10P78369 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN10P78369 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN10P78369 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN10P78369 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN10P78369 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN10P78369 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN10P78369 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN10P78369 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN10P78369 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN10P78369 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN10P78369 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN10P78369 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN10P78369 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN10P78369 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN10P78369 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN10P78369 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN10P78369 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN10P78369 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN10P78369 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms