Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms