Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFM1P61960 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFM1P61960 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UFM1P61960 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UFM1P61960 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UFM1P61960 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UFM1P61960 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UFM1P61960 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UFM1P61960 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UFM1P61960 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UFM1P61960 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UFM1P61960 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UFM1P61960 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UFM1P61960 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UFM1P61960 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UFM1P61960 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UFM1P61960 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UFM1P61960 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFM1P61960 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UFM1P61960 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms