Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VBP1P61758 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VBP1P61758 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms