Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVS71-1P61550 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms