Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA3P59666 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA3P59666 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA3P59666 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA3P59666 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA3P59666 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA3P59666 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DEFA3P59666 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DEFA3P59666 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DEFA3P59666 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms