Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF3P57682 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF3P57682 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF3P57682 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF3P57682 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF3P57682 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF3P57682 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF3P57682 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF3P57682 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF3P57682 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF3P57682 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF3P57682 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF3P57682 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF3P57682 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF3P57682 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF3P57682 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF3P57682 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF3P57682 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF3P57682 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF3P57682 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF3P57682 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF3P57682 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF3P57682 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms