Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBASH3AP57075 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms